Seit der Grundsteinlegung im Jahr 1956 wurde das Werk am Standort Barsinghausen kontinuierlich modernisiert. Die letzte Erneuerung begann vor drei Jahren. Bei der Erstellung des heutigen Fabrikkonzepts wurde die Bahlsen GmbH & Co. KG von den Forschungs- und Beratungsdienstleistern des Instituts für Integrierte Produktion Hannover (IPH) und den Reichardt Maas Assoziierte Architekten (RMA) unterstützt.
Die Ingenieure und Architekten entwickelten ein wandlungsfähiges, logistikgerechtes Fabrikkonzept und veränderten die Werkstruktur des Standorts grundlegend. So wurden beispielsweise Erweiterungsflächen in zuvor ungenutzten Bereichen geschaffen. Als Maßstab für die Restrukturierung diente eine Greenfield-Planung. Dabei werden bestehende Gebäudestrukturen ausgeblendet und die Räumlichkeiten von Grund auf neu geplant. Eine besondere Herausforderung für die Fabrikplaner stellte die Umsetzung der geplanten Neuerungen bei laufender Produktion dar. Die Modernisierung erfolgte, während Bahlsen weiterhin Süßgebäck am Standort produzierte.
Der Wettbewerb „Fabrik des Jahres – Global Excellence in Operations (GEO)“ wird jährlich von der Wirtschaftszeitung Produktion und der Unternehmensberatung A.T. Kearney ausgeschrieben. Teilnehmen können alle produzierenden Unternehmen. Der Wettbewerb gilt als Industrie-Benchmark.
Neben einem Gesamtsieger und einem Sieger in der Kategorie „Global Excellence in Operations“ werden Platzierungen in sechs weiteren Kategorien vergeben, wie z. B. „Hervorragende Standortentwicklung“ und „Hervorragendes Qualitätsmanagement“. Zum „Fabrik des Jahres“-Gesamtsieger wurde in diesem Jahr VW Chemnitz gekürt.